站在中医角度来看发酵食物，专家指出，发酵食物通常保存在阴凉处，本质阴冷，因此体质偏虚冷的人、肠胃道功能本来就不好的人，不适合长期、大量的吃，反而可能增加肠胃负担。邱荣鹏提醒，可以注意自己的大便状况，如果大便变软、次数变多，就表示可能已经过头了。
再加上发酵食物具“发性”，尤其发酵时间不长的食物，发性愈强，因此有皮肤病，或虚火大的人，会口干舌燥、嘴破等，都不适宜吃，恐怕症状会更加严重。
虽然不少原本看似“不健康”的发酵食物逐渐受到肯定，但中西医都提醒，最重要是要控制份量，且均衡饮食、多元摄取，才能将好处全都吃下肚。